La sede del Nodo Sicilia è localizzata presso la sede della Scuola Superiore di Catania, struttura istituita nel 1998, a titolo sperimentale, quale centro di Alta Formazione Universitaria sul modello della Scuola Normale Superiore di Pisa, a seguito di un Accordo di programma tra il MURST (oggi MIUR) e l' Università degli Studi di Catania, per offrire a studenti universitari didattica integrativa e a giovani laureati percorsi formativi di elevata specializzazione e qualificazione.
In questa sede il Nodo Sicilia dispone di locali destinati ad uffici direttivi ed amministrativi e di uffici destinati ad ospitare lo Sportello Informativo per l’assistenza alle imprese, la creazione di spin-off e l’erogazione dei servizi di informazione tecnico-scientifica.
Presso la stessa sede si trovano, inoltre, gli spazi destinati a sala riunioni, conferenze, attività di formazione frontale e seminariale, provvisti di un moderno sistema di video-conferenza.
Il nodo si avvale di laboratori dislocati presso le strutture dei propri soci.