La sede principale del Nodo Puglia è ospitata presso l'Università degli Studi di Bari che ha messo a disposizione per il CCT gli spazi attrezzati per la sede, la struttura di supporto amministrativo-gestionale del nodo e lo Sportello di assistenza alle imprese ed alla creazione di spin-off, che erogherà i servizi di informazione tecnico-scientifica.

La sede del nodo dispone di una sala convegni per le manifestazioni pubbliche e le attività seminariali. Tale sede è localizzata presso il complesso Tecnopolis di Valenzano (BA), in contiguità con gli spazi a disposizione per l'Agenzia Regionale per la Tecnologia e lnnovazione (ARTI) e con l'incubatore d'impresa di Tecnopolis, nonché in contiguità con lo sportello del nodo regionale ICT.

Gli altri sportelli del Nodo Puglia sono stati attivati presso le Università di Lecce e di Foggia. Il nodo si avvale di laboratori dislocati presso i soggetti partecipanti e, in modo particolare del Labo-biotech (BA) che dispone di un attrezzato parco strumenti ed è dotato di strumentazione per videoconferenza.